Kaosun Anatomisi, yasadışı işlerle uğraşan bir adamla yolunun kesişmesiyle hayatı değişen bir doktorun hikayesini konu ediyor. Ozan, acil serviste çalışan idealist, genç bir doktordur. Türkiye’nin en güçlü yasadışı liderlerinden Kenan ile Ozan'ın yollarının beklenmedik bir şekilde kesişmesi her ikisinin hayatının değişmesine neden olur.Kız kardeşinin ani ölümünün ardından bir doktor (Ozan), kendini yerel bir suç örgütünün içinde bulur ve örgütün yeni lideriyle geçici bir ittifak kurmaya çalışır.