Önceki sezon finalinde, McGarrett'in annesinin beklenmedik dönüşü ve Chin'in verdiği zor kararın ardından ekip, ailenin önemli bir üyesini öldüren Wo Fat'in izini bulmaya kararlıdır.
3. Sezon · 24 Bölüm
La O Na Makuahine (Anneler Günü)
Kanalua (Kuşku)
Lana I Ka Moana (Sürüklenen Gemi)
Popilikia (Kötü Şans)
Mohai (Kurban)
I Ka Wa Mamua (Geçmiş Zaman)
Ohuna (Sır)
Wahine ‘inoloa (Kötü Kadın)
Ha’awe Make Loa (Ölüm Arzusu)
Huaka’i Kula (Okul Gezisi)
Kahu (Koruyucu)
Kapu (Yasak)
Olelo Ho’opa’i Make (Ölüm Emri)
Hana I Wa’ Ia (Skandal)
Kancalı Adam
Kekoa (Savaşçı)
Pa’ani (Oyun)
Na Ki’I (Oyuncak Bebekler)
Hoa Pili (Yakın Arkadaş)
Olelo Pa'a (Söz)
Imi Loko Ka 'Uhane (Ruhunu Arayış)
Ho'opio (Rehin Almak)
He Welo 'Oihana (Aile İşi)
Aloha. Malama Pono (Elveda ve Kendine İyi Bak)